Главными природными достопримечательностями Национального заповедника Рас-Мохаммед являются уникальные коралловые рифы, где обитает более 1000 различных красивейших видов рыб. Интересно, что в настоящее время здесь насчитывается около 150 видов восхитительных кораллов. Важно отметить, что на территории Национального заповедника Рас-Мохаммед можно наблюдать в естественных условиях поднявшиеся над водной поверхностью Красного моря впечатляющие коралловые рифы, возраст которых насчитывает, как предполагают учёные океанографы, примерно до 2 миллиардов лет.

Помимо этого, особо пристального внимания заслуживает ещё одно уникальное чудо заповедника Рас-Мохаммед – живописный Магический залив. Стоит отметить, что вода в нём из-за уникальных солёных источников примерно в 2 раза соленей обычной морской воды. Таким образом, вода Магического залива сходна по своему составу с водой знаменитого Мертвого моря, которое расположено на границе двух государств : Израиль и Иордания, и также оказывает полезное, оздоровительное влияние на организм человека.

Кроме богатого подводного мира, заповедник Рас-Мохаммед также довольно богат и представителями сухопутной фауны такими как : газели, лисы, рептилии, перелётные птицы, среди которых белые аисты. На территории Национального заповедника Рас-Мохаммед имеются живописные заросли мангровых деревьев, на листьях которых виден слой соли, поскольку они питаются очень солёной водой из Магического залива. Мангровые деревья играют важную роль в экосистеме заповедника Рас-Мохаммед, так как на ветвях этих деревьев гнездятся и высиживают своих птенцов многие виды птиц.

Другими интересными природными достопримечательностями Национального заповедника Рас-Мохаммед являются геологические разломы земли, которые образовались в результате довольно мощных землетрясений. Одним из которых является уникальный разлом – провал глубиной примерно до 10 метров, что соответствует высоте четырёхэтажного дома. Интересно, что этот провал имеет форму почти равностороннего треугольника. Также на территории заповедника Рас-Мохаммед имеется живописное озеро , которое соединено с Красным морем.

Сегодня для туристов, купивших путевки в Египет, в Национальный заповедник Рас-Мохаммед постоянно организуются экскурсии из города- курорта Шарм-эш-Шейх, причём как на автобусе, так и на катере.